抗体测序服务
单克隆抗体分子在药物研发、诊断试剂开发中扮演了关键的角色。抗体分子的一级结构,特别是其CDR区域的氨基酸序列是发挥其生物学功能的核心,对其完整序列准确快速的分析具有十分重要的意义。卡梅德生物采用最先进的Orbitrap Fusion Lumos质谱仪和强大的抗体测序数据处理软件PEAKS AB Software,结合基因测序和生物信息学数据库,建立了全新一代抗体测序平台,实现对抗体一级结构快速准确的分析从而保证每一个抗体测序的准确性。我们的平台适用于不同亚型抗体,如IgA,IgE,IgG和IgM,以及不同形式的抗体,如荧光偶联抗体,固定化抗体,不同物种的抗体的序列分析。
项目特征:
*仅需200ug抗体即可设计与完成LC-MS/MS 分析
*基于蛋白数据库的de novo蛋白测序技术
*适用于所有物种抗体和不同抗体亚型
*直接定量转录后修饰和变异序列
*14天内出结果(包含节假日)
服务优势:
---抗体测序服务保证100%准确
seline;">我们的测序服务执行严格的质量控制,采用宽进窄出的原则,在不遗漏任何有效数据信息的同时实现了抗体序列的准确鉴定。目前我们实验室使用的Orbitrap Fusion Lumos质谱仪,相比于上一代Orbitrap Elite质谱仪,Lumos在提高了一级二级质谱扫描速度的同时保证肽段分子量的准确性。同时结合我们行业标杆性逻辑算法和强大的处理能力(基于PEAKS软件分析),我们的抗体测序平台将传统技术很难区分分子量接近的氨基酸变得更加容易和精确,如实现分子量差异在0.03Da的谷氨酰胺和赖氨酸差别分析。
---抗体测序服务保证100%序列覆盖
卡梅德生物针对不同的项目需求,会采用多达8种不同的蛋白酶对目标抗体进行消化酶切,利用PEAKS软件自动实现不同轻重链酶切肽段之间100%全序列拼接。对于抗体互补决定区域(CDR区域),至少生成含有单个位点的肽段序列10次,通过高覆盖率,以保证后续抗体序列拼接准确。
---强大的修饰分析能力
我们的抗体测序平台能够高效地区分同源氨基酸的不同变异体,通过二级碎裂片段的特征峰即可实现亮氨酸和异亮氨酸的准确判定。对于转录后修饰的氨基酸分子,我们的系统也能高效区分。
---适用于荧光标记单抗、IgMs、及其他非传统抗体进行测序
我们的抗体测序技术同样能够高效地完成小基团,如FITC、Biotin、Alexa等标记抗体的测序工作,在增加抗体样品量的情况下,我们也能完成类似GST等大蛋白基团标记的抗体测序工作。我们的技术适用于任何类型的抗体测序工作,目前我们已经成功测序来自小鼠,兔子,羊驼,仓鼠和羊的抗体。在实际操作中,IGM的测序方法类似IgG,只是前者需要更多的蛋白样品。
---严谨的序列预测和严格的序列验证
对于每一个抗体测序项目,我们都会给出具体的实验方案。首先,我们会先对项目抗体进行序列预测。如客户直接提供杂交瘤,我们也可以先进行抗体测序后,再结合mRNA测序信息,以确保抗体单个氨基酸测序的准确性。同时,我们还会建立以测定序列为基础的数据库,采用序列确认的模式对采集到的质谱数据进行二次比对分析,以确保交付的产品完全无误。